Правомерно ли взимать налог за продажу доли в квартире не с дохода (стоимости доли), а со стоимости всей квартиры

Здравствуйте! В марте 2016 года я получила в наследство однокомнатную квартиру на праве общей долевой собственности, в следующих долях: 1/3 доля — моей сестре, 1/3 доля — моему брату, 1/3 доля — мне. В сентябре 2016 года по одному договору купли – продажи мы продали свои доли одному покупателю за 1 200 000 рублей 00 копеек. В результате продажи каждый из нас получил доход в размере 400 000 рублей. В 2017 году я представила в налоговый орган по месту своего учёта налоговую декларацию о доходах физических лиц по форме 3-НДФЛ с нулевой суммой налога. Сейчас налоговый инспектор утверждает, что я неправильно заполнила декларацию и мне необходимо оплатить налог на доходы физических лиц с доходов, полученных физическими лицами в соответствии со статьёй 228 НК РФ в сумме 8 667 рублей и пени -100 руб. Налоговая инспекция считает, что, если бы мы продавали свои доли каждый по отдельному договору купли-продажи, то налог бы не платили, так как цена каждой доли составляет 400 тыс. руб. А так как у нас один договор купли — продажи, то налог считают исходя из суммы продажи объекта, т.е. 1 200 000 руб. Формула расчёта: 1 200 000 руб. – 1 000 000руб. (налоговый вычет) = 200 000 руб. разделить на 3 чел. = 66 667руб.*13%=8667руб. Я не хочу платить налог с полной стоимости квартиры, потому что моя 1/3 доля составляет 400 тыс. руб. Зависит ли сумма налога от полученного мною дохода (400 000 рублей) или от способа оформления договора купли-продажи (один договор на 3 доли или 3 договора на каждую долю отдельно)? Ведь как бы мы не оформили договор купли-продажи в одном экземпляре или три разных договора на каждого собственника, суть договора одна: 400 000 руб. дохода на человека, а не 1 200 000 рублей.